怀孕期间，胎儿的游离DNA (cell-free fetal DNA, cffDNA)会通过胎盘进入母亲的血液系统。人类的23对染色体中有一对是性染色体，女性的性染色体为XX，而男的性染色体为XY。在正常情况下，女性的身体及血液中是不会带有Y染色体及SRY基因的，除非该女士已怀有男性的胎儿。
检测母体血液中Y染色体的存在，让医生能根据结果据进行医学诊断，例如(1) 用作产前无创亲子鉴定，(2) 用作父系祖源追溯，(3) 用作排除胎儿性联遗传病患者，这些检测是基于Y染色体而进行检测的。
检测怀孕妇女的血液中是否带有SRY基因，而SRY基因是男性性染色体(Y染色体)独有的基因。
男性的性染色体为XY，而Y染色体上有SRY基因，女性为XX，在一般情况下，女性的血液中不会侦测到SRY基因。结果会以Negative (阴性) 或Positive (阳性) 显示。
不建议。胎儿的游离DNA 在母血内的浓度会影响结果的准确性，怀孕5周或以后的胎儿的游离DNA浓度才足够进行检测。
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NIPPT无创胎儿亲子鉴定，也称「无创产前亲子鉴定」，利用最先进的基因分析技术，从孕妇血液中分析胎儿的基因信息，与疑父的基因信息作对比，以确认亲子关系，满足政府机构的政策要求、厘清个人心中疑惑，或确认扶养与财产责任等。
孕妇在怀孕期间，胎儿的游离DNA会经过胎盘进入母体的血液系统。无创胎儿亲子鉴定只需抽取孕妇静脉血液便可取得胎儿的DNA，分析与疑父的关系。传统胎儿亲子鉴定是需要透过羊水穿刺或绒毛穿刺来获得胎儿DNA，这些技术会增加胎儿流产风险，无创胎儿亲子鉴定无流产风险，让孕妇可以安心检测。
| 无创胎儿亲子鉴定 | 绒毛产前亲子鉴定 | 羊水产前亲子鉴定 | |
|---|---|---|---|
| 样品采集方式 | 非侵入性 | 侵入式性 | 侵入性 |
| 孕妇样品 | 母体血液约10升 | 绒毛膜 | 羊水 |
| 疑父样品 | 血液、毛发、指甲 | 血液、毛发、指甲 | 血液、毛发、指甲 |
| 采样所需时间 | 1-3分钟 | 约30分钟 | 约30分钟 |
| 采样怀孕周数 | 6周或以上 | 11-15周 | 16-20周 |
| 准确率 | 99.999999% | 99.99%以上 | 99.99%以上 |
| 风险 | 无风险 | 有流产风险 | 有流产风险 |
胎儿的DNA有一半是来自父亲，只要用疑父DNA上的SNP位点与胎儿的位点作比较，便可分析两者之间的亲缘关系。
匹配的有效SNP位点越多，亲子概率越高。以下是报告上会显示的结果：
